如何计算lncRNA与基因的表达相关性(lncRNA,开发技术)

时间:2024-05-02 17:39:39 作者 : 石家庄SEO 分类 : 开发技术
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计算lncRNA 与基因的表达相关性

在构建ceRNA 网络时,需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene) 间的表达相关性,一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢?

1. 首先获得lncRNA 的表达矩阵

从lncRNA 的表达数据来看,是5个lncRNA 在100个样本中的表达量矩阵。

2. 获得 gene 的表达矩阵

从基因的表达矩阵来看,是4个基因在100个样本的表达量矩阵。

3. 计算lncRNA 与gene 的表达相关性

本文:如何计算lncRNA与基因的表达相关性的详细内容,希望对您有所帮助,信息来源于网络。
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