怎么从TCGA数据库中下载指定类型样本的数据
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摘要: 其实可以用TCGAbiolinks 软件包中的GDCquery 函数,指定sample.type 去筛选样本。比如:需要下载实体瘤组织的样本,那么指定sample.type 为 “Primary solid Tumor”即可:query<-GDCquery(project="TCGA-LGG",legacy=TRUE,data.ca... ...
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(为您整理了一些要点),点击可以直达。其实可以用TCGAbiolinks 软件包中的GDCquery 函数,指定sample.type 去筛选样本。
比如:需要下载实体瘤组织的样本,那么指定sample.type 为 “Primary solid Tumor”即可:
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